34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1599 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  100 
 
 
226 aa  466  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  53.6 
 
 
330 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  50.45 
 
 
242 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  39.66 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  49.57 
 
 
277 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  54.32 
 
 
116 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  51.85 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  45.1 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  42.59 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  57.53 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  43.02 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  39.78 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  36.89 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  39.02 
 
 
84 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  36.56 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  36.08 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  47.17 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  33.33 
 
 
348 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  33.33 
 
 
323 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  28.28 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  28.85 
 
 
395 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  31.11 
 
 
223 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  32.89 
 
 
277 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  21.38 
 
 
309 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  33.77 
 
 
278 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  33.85 
 
 
422 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  24.39 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  24.14 
 
 
309 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  31.25 
 
 
335 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  32.47 
 
 
278 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  26.45 
 
 
271 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  32.47 
 
 
278 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 
515 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  36.36 
 
 
419 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>