34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4474 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  100 
 
 		 271 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  39.81 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  58.42 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  58 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  40 
 
 		 213 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  48.6 
 
 		 367 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  44.74 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  48.54 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  53.06 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  48.91 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  50 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  36.91 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  44.55 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  42.57 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  44.55 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  40.38 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  50.82 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  34.65 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  34.65 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  42.68 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  33.7 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  33.04 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  36.46 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  29.91 
 
 		 426 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  31.51 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  29.58 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  26.55 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  27.63 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  26.45 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3148  HNH nuclease  29.01 
 
 		 263 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>