32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2196 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  100 
 
 
274 aa  563  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  53.57 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  52.25 
 
 
247 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  58.65 
 
 
311 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  48.41 
 
 
367 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  52.43 
 
 
224 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  50 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  42.24 
 
 
267 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  44.07 
 
 
212 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  45.05 
 
 
213 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  40.31 
 
 
281 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  35.12 
 
 
253 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  37.32 
 
 
281 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  37.12 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  42.06 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  44.44 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  27.37 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  36.44 
 
 
268 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  48.44 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  44.79 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  44.79 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  39.33 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  54.55 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  42.47 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  39.58 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  43.33 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  34.78 
 
 
109 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  36.99 
 
 
371 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  34.72 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  41.43 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  27.85 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  31.03 
 
 
426 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>