20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0933 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  100 
 
 		 371 aa  768    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  27.42 
 
 		 249 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2091  hypothetical protein  30.56 
 
 		 155 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0972757  normal  0.149927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  34.04 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  29.91 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  27.73 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 253 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  32.39 
 
 		 211 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  32.39 
 
 		 211 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  30 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  32.08 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  28.93 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  27.43 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  29.58 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  25.68 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  27.78 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  26.76 
 
 		 281 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  24.29 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  23.01 
 
 		 270 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>