32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0503 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  39.81 
 
 		 271 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  47.06 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  58.56 
 
 		 224 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  57.27 
 
 		 367 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  51.79 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  51.28 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  49.11 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  44.64 
 
 		 212 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  58.65 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  51 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  41.61 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  46.67 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  47.47 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  39.17 
 
 		 261 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  39.52 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  37.38 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  33.52 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  56.45 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  37.61 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  37.61 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 109 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  36.61 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  39.5 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  34.83 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  30.63 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4907  hypothetical protein  64.29 
 
 		 40 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2811  HNH endonuclease  30.67 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  34.85 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  24.29 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>