32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2957 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  100 
 
 		 253 aa  530  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  51.28 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  39.74 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  48.74 
 
 		 367 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  48.54 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  45.95 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  48 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  42.86 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  45.1 
 
 		 212 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  45.83 
 
 		 314 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  52.44 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  39.17 
 
 		 281 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  35.12 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  44.72 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  42.06 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  43.56 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  32.88 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  34.68 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  51.61 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  37.74 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  35.96 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  37.61 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  20.9 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  23.31 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4907  hypothetical protein  54.84 
 
 		 40 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  26.09 
 
 		 278 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>