43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1720 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  44.76 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  43.81 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  44.04 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  43.56 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  39.25 
 
 		 213 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  38.83 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  42.06 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  37.38 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  37.86 
 
 		 224 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 367 aa  88.6  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  32.88 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  29.05 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  38.24 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0087  protein of unknown function DUF55  34.81 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0084  protein of unknown function DUF55  34.81 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.260704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  35.78 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  42.67 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  38.14 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  38.14 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  29.35 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  39.56 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 109 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  42.11 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  45 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  36.56 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  27.43 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  29.55 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  39.34 
 
 		 431 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  32.05 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  23.08 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  25.66 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  27.97 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  23.02 
 
 		 142 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  24.11 
 
 		 137 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  24.34 
 
 		 173 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  23.08 
 
 		 137 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  32.61 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  23.4 
 
 		 137 aa  42  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>