30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2060 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  100 
 
 		 109 aa  228  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  51.96 
 
 		 249 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  50.59 
 
 		 211 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  50.59 
 
 		 211 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  40.78 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  43.04 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  42.53 
 
 		 283 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  43.68 
 
 		 268 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  45.07 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  41.18 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  39.47 
 
 		 311 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  34.52 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  43.37 
 
 		 285 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  40.7 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  41.38 
 
 		 431 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  38.67 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  36 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 274 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  27.37 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  29.63 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  39.74 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  26.32 
 
 		 371 aa  41.6  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>