14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2134 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  100 
 
 		 431 aa  888    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  36.45 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  36.45 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 109 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  27.16 
 
 		 213 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  42.31 
 
 		 285 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  34.95 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  34.41 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  26.45 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.36 
 
 		 914 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  28.89 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  26.8 
 
 		 282 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>