31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1508 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  100 
 
 		 224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  58.56 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  58.42 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  55.93 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  53.57 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  50 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  55.96 
 
 		 367 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  51.35 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  48.65 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  38.97 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  47.57 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  43.97 
 
 		 281 aa  104  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  42.74 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  51 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  44.72 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  38.61 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  39.6 
 
 		 270 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  60.32 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  37.86 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  33.91 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  37.5 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  45.21 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  50 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  32.76 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  32.76 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  35.42 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  28.21 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4907  hypothetical protein  65.52 
 
 		 40 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>