19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2534 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  100 
 
 		 426 aa  882    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  36.56 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  35.16 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  27.55 
 
 		 211 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  27.55 
 
 		 211 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  34.91 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  35.79 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  27.81 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  30.53 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  29.91 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  26.45 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  29.35 
 
 		 213 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  30.7 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  31.03 
 
 		 274 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  31.76 
 
 		 277 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  32.63 
 
 		 270 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  37.66 
 
 		 314 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  31.58 
 
 		 101 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>