27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2278 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  96.04 
 
 		 101 aa  203  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  46.24 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  41.24 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  38.78 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  38.78 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  38.14 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  36.56 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  38.71 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  41.25 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  35.96 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  38.2 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  35.87 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  30.21 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  32.98 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  32.14 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  36.25 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  35 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  28.72 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4397  hypothetical protein  37.63 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  29.49 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04249  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48677  predicted protein  24.59 
 
 		 304 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 426 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  27.85 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>