26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9910 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  239  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  69.52 
 
 		 109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  53.68 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  46.79 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  48.62 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  40.78 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  41.82 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  47.67 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  44.44 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  42.27 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  42.27 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  41.3 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4397  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  66.6  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1508  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.243875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  34.02 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  30.21 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  29.17 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  34.02 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  31.96 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  30.12 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0052  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000489669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  28.57 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>