26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3763 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  46.24 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  43.01 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  40.45 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  39.77 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  36.05 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  35.63 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  36.05 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  34.52 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  35.56 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  34.12 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  32.56 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  36.47 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  36.9 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  32.26 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  37.97 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  33.72 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4397  hypothetical protein  34.52 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  30.12 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  32.05 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  30.12 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  29.67 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48677  predicted protein  26.36 
 
 
304 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04249  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 
311 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>