25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1749 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  63.21 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  45.83 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  42.53 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  43.88 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  34.02 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  32.98 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04249  conserved hypothetical protein  33.71 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  35.56 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  39.33 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  32.99 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  31.91 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  32.29 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  34.41 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  32.41 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48677  predicted protein  29.84 
 
 		 304 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  31.37 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  32.29 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  34.04 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  32.98 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  30.69 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>