26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3183 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  79.03 
 
 
124 aa  192  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  77.48 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  76.47 
 
 
125 aa  167  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  76.47 
 
 
125 aa  167  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  76.36 
 
 
124 aa  167  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  47.52 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  43.75 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  39.02 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4397  hypothetical protein  52.13 
 
 
94 aa  87  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  44.68 
 
 
114 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  47.42 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  42.2 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  45.12 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  43.01 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  38.14 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  36.08 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0052  hypothetical protein  48 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000489669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  34.88 
 
 
95 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1508  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.243875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  34.48 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  30.3 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  29.41 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>