25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4529 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  84.21 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  77.78 
 
 		 124 aa  186  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  74.34 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  78.1 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  78.1 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  45.36 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  48.86 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  47.42 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  47.31 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  37.72 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  43.56 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4397  hypothetical protein  54.95 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  41.24 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  39.18 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  43.9 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  38.1 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  37.93 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0052  hypothetical protein  54.69 
 
 		 70 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000489669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  36.47 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1508  hypothetical protein  36.26 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.243875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  35.29 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  35.64 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  30.69 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  29.41 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>