26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1252 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  99.2 
 
 		 125 aa  249  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  92.5 
 
 		 124 aa  226  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  77.19 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  78.1 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  78.5 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  37.72 
 
 		 115 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  49.44 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4397  hypothetical protein  50.54 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  40.83 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  40.37 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  43.9 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  38.78 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  42.68 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  36.73 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0052  hypothetical protein  52.24 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000489669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  36.05 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1508  hypothetical protein  37.08 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.243875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  36.47 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  31.18 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  29.03 
 
 		 101 aa  40  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>