23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3330 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  256  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  63.21 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  37.76 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  40.45 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  60.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04249  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  33.72 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  31.96 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48677  predicted protein  31.2 
 
 
304 aa  50.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  33.65 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  35.64 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  29.91 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  31.52 
 
 
113 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  31.58 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  32.26 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  35.48 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  31.18 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>