26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3207 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  244  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  83.87 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1199  hypothetical protein  78.51 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309987  normal  0.710825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  76.11 
 
 		 124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  79.21 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  79.21 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  42.2 
 
 		 113 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  38.53 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  46.67 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  40 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4397  hypothetical protein  52.75 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  47.31 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  42.39 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  39.25 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  38.14 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  36.73 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  36.08 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0052  hypothetical protein  56.25 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000489669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1508  hypothetical protein  38 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.243875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  36.9 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  37.65 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  35.42 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  32.29 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  29.17 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  29.55 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>