24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1843 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1843  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  207  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3330  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1749  hypothetical protein  45.83 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2439  hypothetical protein  41.18 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347187  normal  0.0645609 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7146  Restriction endonuclease  33 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3763  hypothetical protein  39.77 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0307245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2823  hypothetical protein  39.39 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9910  hypothetical protein  34.02 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1470  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6905  hypothetical protein  33.98 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187347  normal  0.419367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0436  hypothetical protein  33.96 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2703  hypothetical protein  35.35 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.644509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2278  hypothetical protein  28.72 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04249  conserved hypothetical protein  33.73 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2576  hypothetical protein  27.66 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3207  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  29.41 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3183  hypothetical protein  30.3 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48677  predicted protein  25.6 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1267  hypothetical protein  28.87 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1413  hypothetical protein  29.03 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738507  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4529  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1252  hypothetical protein  29.03 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.439706  normal  0.500104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>