37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3795 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  100 
 
 		 224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  53.98 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  54.46 
 
 		 367 aa  138  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  51.79 
 
 		 311 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  55.93 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  51.43 
 
 		 247 aa  127  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 271 aa  124  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  41.61 
 
 		 297 aa  124  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  39.74 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  52.43 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  50 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  46.36 
 
 		 212 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  47.37 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  44.76 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  44.79 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  45.63 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  42.48 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  39.37 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  57.63 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  40.37 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  34.03 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  40.17 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  40.17 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  43.04 
 
 		 109 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  32.69 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  26.74 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  27.81 
 
 		 426 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  26 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4907  hypothetical protein  58.06 
 
 		 40 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 330 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  30.88 
 
 		 324 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  28.99 
 
 		 371 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  31.19 
 
 		 431 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>