28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2154 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  41.61 
 
 		 224 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  51.06 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  51.46 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  41.61 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  36.91 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  44.64 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  54.55 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  52.44 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  54.22 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  42.74 
 
 		 224 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  47.83 
 
 		 213 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  38.02 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 267 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  45.65 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  47.52 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  49 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  24.08 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  37.97 
 
 		 211 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  37.97 
 
 		 211 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  36.17 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  40.7 
 
 		 109 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  44.44 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  29.68 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  23.51 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>