179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0044 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  283  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  86.13 
 
 		 137 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  85.4 
 
 		 137 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  83.21 
 
 		 137 aa  245  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  78.83 
 
 		 137 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  77.37 
 
 		 137 aa  230  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  75.18 
 
 		 137 aa  224  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  70.07 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  64.23 
 
 		 139 aa  189  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  61.76 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  62.04 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  61.03 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  61.03 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  59.12 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  60.29 
 
 		 139 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  60.58 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  58.39 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  58.39 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  56.93 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  58.39 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  57.66 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  57.04 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  58.39 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  55.47 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  55.47 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  55.47 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  54.81 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  54.74 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  54.74 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  53.28 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  50.74 
 
 		 141 aa  153  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  52.9 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  50.36 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  53.62 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  52.9 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  52.21 
 
 		 135 aa  147  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  49.28 
 
 		 143 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  53.38 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  47.22 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  46.62 
 
 		 138 aa  133  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  47.22 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  46.97 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  46.67 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  45.83 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  46.53 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  48.87 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  42.22 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  43.7 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  45.93 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  42.65 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  45.31 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  42.11 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  42.22 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  43.05 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  45.32 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  39.74 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  40.4 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  39.87 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  39.07 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  103  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  35.76 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  38.41 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  38.36 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  34.69 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  36.84 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  38.78 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  35.53 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  35.76 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  40.52 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  38.82 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  32.68 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  35.76 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  35.57 
 
 		 158 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  39.07 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  39.07 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  39.07 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  39.07 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  38.16 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  38.16 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  37.75 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  37.58 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  39.74 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  36.42 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1030  protein of unknown function DUF55  34.21 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  37.75 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  34.67 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0831  hypothetical protein  35.76 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  38 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  34.21 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  37.75 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0836  hypothetical protein  36.91 
 
 		 194 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  35.17 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  34.93 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  33.1 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  33.55 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>