18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3148 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3148  HNH nuclease  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  42.8 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2975  hypothetical protein  41.89 
 
 		 645 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0026  hypothetical protein  38.06 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.410419  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 		 2759 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.48 
 
 		 967 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  31.1 
 
 		 1597 aa  65.5  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  39.24 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  27.36 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  31.65 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  37.84 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  37.84 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  37.84 
 
 		 489 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  37.84 
 
 		 480 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  37.84 
 
 		 466 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  29.01 
 
 		 271 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  37.84 
 
 		 481 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>