14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2975 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2975  hypothetical protein  100 
 
 		 645 aa  1294    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  24.37 
 
 		 967 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0026  hypothetical protein  28.36 
 
 		 346 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.410419  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3148  HNH nuclease  41.89 
 
 		 263 aa  114  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  28.01 
 
 		 1597 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  34.29 
 
 		 2759 aa  78.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  37.5 
 
 		 497 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0986  hypothetical protein  23.41 
 
 		 305 aa  50.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0008  hypothetical protein  20.49 
 
 		 529 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  29.83 
 
 		 559 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19600  hypothetical protein  26.71 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  32 
 
 		 524 aa  48.5  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  37.18 
 
 		 521 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>