82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3568 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  100 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  50 
 
 		 221 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  39.71 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 163 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 80 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 80 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 174 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 174 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  39.34 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 189 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  43.55 
 
 		 81 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 171 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  36.49 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 143 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 172 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 177 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  41.51 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  32 
 
 		 170 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 198 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2811  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 436 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 199 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 111 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  37.04 
 
 		 168 aa  46.2  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  38.89 
 
 		 168 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 422 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 174 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  38.33 
 
 		 113 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  37.04 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  40.74 
 
 		 168 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  41.51 
 
 		 174 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  38.89 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 169 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 169 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 189 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 170 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  37.74 
 
 		 177 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 81 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  28.89 
 
 		 168 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  30 
 
 		 174 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  37.74 
 
 		 176 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  28.89 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  38.89 
 
 		 187 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 174 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  32.39 
 
 		 587 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  38.71 
 
 		 133 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 169 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  30.68 
 
 		 189 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  38.89 
 
 		 185 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  38.89 
 
 		 185 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 177 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0563  hypothetical protein  30.16 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 197 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 178 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  27.71 
 
 		 139 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 388 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3148  HNH nuclease  31.65 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  40 
 
 		 461 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 182 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 189 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 417 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  25.3 
 
 		 194 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 418 aa  42.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  25.3 
 
 		 194 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  38.89 
 
 		 185 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 111 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>