More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5242 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
587 aa  1216    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  36.59 
 
 
503 aa  250  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  38.7 
 
 
483 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 
504 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 
488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  34.73 
 
 
439 aa  240  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0466  group II intron reverse transcriptase/maturase  35.64 
 
 
599 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  38.03 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  34.47 
 
 
503 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  39.21 
 
 
553 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0025  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.6 
 
 
507 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0016  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.6 
 
 
507 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.934591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4858  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.6 
 
 
502 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0055  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.6 
 
 
502 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4841  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.6 
 
 
502 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0017  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.6 
 
 
502 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3327  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.86 
 
 
502 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0089  reverse transcriptase  36.28 
 
 
632 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0077  reverse transcriptase  36.28 
 
 
632 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0589009  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.95 
 
 
548 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.95 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.95 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.95 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.95 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.95 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  35.28 
 
 
549 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  35.62 
 
 
515 aa  223  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  35.62 
 
 
515 aa  223  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  35.62 
 
 
515 aa  223  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1884  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.19 
 
 
610 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1017  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.19 
 
 
610 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0781817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4056  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.19 
 
 
610 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1054  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.19 
 
 
610 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.200427  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0165  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.19 
 
 
610 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508109  hitchhiker  6.15504e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4163  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.19 
 
 
610 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.05 
 
 
507 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  36.22 
 
 
544 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  36.87 
 
 
492 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  32.61 
 
 
561 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  35.83 
 
 
569 aa  220  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  34.86 
 
 
568 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  36.19 
 
 
585 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  36.12 
 
 
571 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 
503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  35.84 
 
 
565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3857  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.17 
 
 
604 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  36.79 
 
 
585 aa  217  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  36.69 
 
 
585 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01366  hypothetical maturase  34.7 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.702192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  37.56 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 
505 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1762  group II intron-encoded protein LtrA  36.31 
 
 
604 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4556  group II intron-encoded protein LtrA  36.31 
 
 
604 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000506643  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5597  group II intron-encoded protein LtrA  36.31 
 
 
604 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.147853  hitchhiker  0.000000000602263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 
495 aa  212  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1685  retron-type reverse transcriptase  36.61 
 
 
599 aa  212  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.950387  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3347  RNA-directed DNA polymerase  38.8 
 
 
381 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.24 
 
 
605 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0255712  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C19  maturase MatR  36.34 
 
 
599 aa  210  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2751  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.52 
 
 
618 aa  210  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  33.26 
 
 
560 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  33.26 
 
 
560 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2082  RNA-directed DNA polymerase  28.26 
 
 
635 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0034  group II intron reverse transcriptase/maturase  32.75 
 
 
627 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1618  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000636906  hitchhiker  0.000000000000550097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2196  RNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 
633 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.035125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2375  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0975  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.171918  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.46 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  35.64 
 
 
490 aa  209  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3928  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.51 
 
 
633 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0624  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0142  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0584  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.84 
 
 
602 aa  208  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0812  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.158231  hitchhiker  0.0000219513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102915  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1714  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.125991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2185  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1923  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2652  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1387  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.017267  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02784  hypothetical maturase  33.97 
 
 
423 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1901  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0976  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.307448  normal  0.190974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 
490 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  35.34 
 
 
482 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  35.34 
 
 
482 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  35.34 
 
 
482 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2067  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121404  normal  0.0104805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2778  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.82 
 
 
475 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00457  hypothetical maturase  34.43 
 
 
423 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  36.07 
 
 
504 aa  207  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>