More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3857 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3857  reverse transcriptase/endonuclease protein  100 
 
 
604 aa  1239    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1017  group II intron reverse transcriptase/maturase  46.91 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0781817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1884  group II intron reverse transcriptase/maturase  46.91 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0165  group II intron reverse transcriptase/maturase  46.91 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508109  hitchhiker  6.15504e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4163  group II intron reverse transcriptase/maturase  46.91 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1054  group II intron reverse transcriptase/maturase  46.91 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.200427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4056  group II intron reverse transcriptase/maturase  46.91 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0466  group II intron reverse transcriptase/maturase  46.24 
 
 
599 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2751  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.5 
 
 
618 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3675  group II intron reverse transcriptase/maturase  44.46 
 
 
642 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0018  group II intron reverse transcriptase/maturase  44.46 
 
 
642 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3691  reverse transcriptase/endonuclease  44.46 
 
 
642 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0120  reverse transcriptase  44.46 
 
 
642 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0016  group II intron reverse transcriptase/maturase  44.46 
 
 
642 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3699  group II intron reverse transcriptase/maturase  44.46 
 
 
642 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0035  group II intron reverse transcriptase/maturase  43.12 
 
 
643 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0034  group II intron reverse transcriptase/maturase  43.9 
 
 
627 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0013  group II intron reverse transcriptase/maturase  43.21 
 
 
599 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.631939 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0089  reverse transcriptase  34.91 
 
 
632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0077  reverse transcriptase  34.91 
 
 
632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0589009  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.37 
 
 
605 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2082  RNA-directed DNA polymerase  34.87 
 
 
635 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  39.17 
 
 
587 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  32.9 
 
 
483 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.99 
 
 
469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  35.11 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5396  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.42 
 
 
456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.476043  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  35.36 
 
 
553 aa  183  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2085  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.06 
 
 
420 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1421  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.06 
 
 
420 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1201  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.06 
 
 
420 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
566 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.36 
 
 
548 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2165  group II intron, maturase  33.6 
 
 
455 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.052518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3326  group II intron, maturase  33.6 
 
 
455 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18750  RNA-directed DNA polymerase  33.76 
 
 
455 aa  181  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.844696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  36.56 
 
 
488 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.08 
 
 
548 aa  180  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.08 
 
 
548 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.08 
 
 
548 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.08 
 
 
548 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.08 
 
 
548 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1070  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.84 
 
 
446 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000276308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3163  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.88 
 
 
420 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5597  group II intron-encoded protein LtrA  33.69 
 
 
604 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.147853  hitchhiker  0.000000000602263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1762  group II intron-encoded protein LtrA  33.69 
 
 
604 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4556  group II intron-encoded protein LtrA  33.69 
 
 
604 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000506643  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 
549 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  29.23 
 
 
568 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3919  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2051  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4151  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  33.69 
 
 
482 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  33.69 
 
 
482 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  33.69 
 
 
482 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  31.29 
 
 
561 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2924  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1471  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000733074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0293  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.51 
 
 
446 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1292  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  30.2 
 
 
571 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1508  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
434 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0483  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.24 
 
 
419 aa  177  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3727  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.83 
 
 
465 aa  177  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1915  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.51 
 
 
446 aa  176  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.552101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  31.1 
 
 
565 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2375  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1618  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000636906  hitchhiker  0.000000000000550097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0975  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.171918  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.23 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3200  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.69 
 
 
467 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0955  group II intron, maturase  36.51 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2471  group II intron, maturase  36.51 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.546508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  28.57 
 
 
585 aa  174  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  30.32 
 
 
503 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.75 
 
 
507 aa  173  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1430  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.55 
 
 
460 aa  173  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0629  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.55 
 
 
411 aa  173  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  28.62 
 
 
585 aa  173  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  28.7 
 
 
569 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1723  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.03 
 
 
420 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0156  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.25 
 
 
470 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0231  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.21 
 
 
460 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0749  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.57 
 
 
470 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0963  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.21 
 
 
460 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.120749  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1089  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.21 
 
 
460 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000601644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0939  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.21 
 
 
460 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000533516  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1257  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.21 
 
 
460 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0093  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.21 
 
 
460 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.21 
 
 
460 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1255  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.71 
 
 
472 aa  171  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0688  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.21 
 
 
390 aa  171  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000168901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>