More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6987 on replicon NC_013733
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  100 
 
 		 507 aa  1046    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  41.14 
 
 		 488 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  39.02 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4841  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.7 
 
 		 502 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0025  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.46 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0016  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.46 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.934591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4858  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.7 
 
 		 502 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0055  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.7 
 
 		 502 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0017  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.7 
 
 		 502 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485362  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3327  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.56 
 
 		 502 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  34.85 
 
 		 504 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  35.05 
 
 		 587 aa  223  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  34.76 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 		 553 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.28 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.28 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.28 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.28 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.28 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.28 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0975  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.171918  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2375  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1618  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000636906  hitchhiker  0.000000000000550097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.27 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.36 
 
 		 422 aa  212  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3347  RNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 381 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  34.83 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.26 
 
 		 602 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  33.97 
 
 		 635 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2269  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  32.05 
 
 		 446 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.295773  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  34.99 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  34.99 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  34.99 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  33.76 
 
 		 635 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  33.65 
 
 		 492 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  33.03 
 
 		 504 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.59 
 
 		 469 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  33.03 
 
 		 504 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0089  reverse transcriptase  33.49 
 
 		 632 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1762  group II intron-encoded protein LtrA  34.05 
 
 		 604 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5597  group II intron-encoded protein LtrA  34.05 
 
 		 604 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.147853  hitchhiker  0.000000000602263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4556  group II intron-encoded protein LtrA  34.05 
 
 		 604 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000506643  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0077  reverse transcriptase  33.49 
 
 		 632 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0589009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  33.03 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  33.03 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  33.91 
 
 		 549 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01366  hypothetical maturase  30.23 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.702192  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 592 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  33.03 
 
 		 489 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  33.03 
 
 		 489 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 576 aa  196  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  33.03 
 
 		 489 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 576 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 576 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 489 aa  196  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  33.58 
 
 		 503 aa  196  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4151  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3919  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2924  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1471  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000733074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1508  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2051  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.72 
 
 		 661 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  35.56 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1292  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0664  RNA-directed DNA polymerase  27.92 
 
 		 605 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00457  hypothetical maturase  29.68 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 		 648 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 		 648 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  35.89 
 
 		 495 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  34.47 
 
 		 571 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02784  hypothetical maturase  30 
 
 		 423 aa  189  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  32.77 
 
 		 585 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  35.02 
 
 		 568 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3937  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.69 
 
 		 613 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  34.23 
 
 		 490 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1685  retron-type reverse transcriptase  33.16 
 
 		 599 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.950387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  33.58 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  34 
 
 		 560 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  33.01 
 
 		 585 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  34 
 
 		 560 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C19  maturase MatR  32.9 
 
 		 599 aa  187  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 		 585 aa  187  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>