More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0567 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  100 
 
 
439 aa  903    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2269  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  46.38 
 
 
446 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.295773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3886  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4118  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.76 
 
 
440 aa  339  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  42.36 
 
 
454 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2197  RNA-directed DNA polymerase  39.76 
 
 
458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.187035  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4151  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2051  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2924  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1471  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000733074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3919  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1508  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1292  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0690  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.05 
 
 
429 aa  309  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2250  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.05 
 
 
429 aa  309  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461169  normal  0.551741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3822  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.05 
 
 
429 aa  309  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.424359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 
483 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.05 
 
 
434 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.70829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1986  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.76 
 
 
433 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.289767  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  38.39 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0975  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.171918  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1618  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000636906  hitchhiker  0.000000000000550097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2375  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.91 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1235  GBSi1, group II intron, maturase  39.14 
 
 
425 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.29 
 
 
469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  34.73 
 
 
587 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00457  hypothetical maturase  37.43 
 
 
423 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01366  hypothetical maturase  37.17 
 
 
423 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.702192  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.52 
 
 
602 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  37.1 
 
 
482 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  37.1 
 
 
482 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  37.1 
 
 
482 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  35.92 
 
 
549 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.52 
 
 
548 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02784  hypothetical maturase  36.46 
 
 
423 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.52 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.52 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.52 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.52 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.52 
 
 
548 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  39.51 
 
 
561 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  34.52 
 
 
553 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5396  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.77 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.476043  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.76 
 
 
507 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0955  group II intron, maturase  35.11 
 
 
434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2471  group II intron, maturase  35.11 
 
 
434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.546508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3727  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.73 
 
 
465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  35.45 
 
 
566 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  38.32 
 
 
569 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2376  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2156  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1333  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0724737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3888  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.248408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4251  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.90502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4139  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0183  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0252  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0645  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.59 
 
 
467 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0867872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3200  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.67 
 
 
467 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2165  group II intron, maturase  33.33 
 
 
455 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.052518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3326  group II intron, maturase  33.33 
 
 
455 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  37.12 
 
 
585 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1250  group II intron-encoding maturase  35.04 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1252  group II intron-encoding maturase  35.04 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.811711  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1624  group II intron-encoding maturase  35.04 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817921  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  37.12 
 
 
585 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5394  RNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.172533  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  36.86 
 
 
568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0248  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.13 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.49 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0566133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  37.84 
 
 
635 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1255  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.49 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 
571 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0635  group II intron-encoding maturase  35.04 
 
 
473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3868  group II intron-encoding maturase  35.04 
 
 
473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1373  reverse transcriptase/maturase  35.14 
 
 
529 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1430  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.41 
 
 
460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1723  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.77 
 
 
420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  36.61 
 
 
503 aa  213  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1846  group II intron-encoding maturase  34.77 
 
 
473 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0227105  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3172  group II intron-encoding maturase  34.77 
 
 
473 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547257  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3820  group II intron-encoding maturase  34.77 
 
 
473 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.336915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  37.84 
 
 
635 aa  212  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  34.53 
 
 
495 aa  212  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  33.41 
 
 
495 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  33.41 
 
 
495 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1349  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.54 
 
 
457 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000323944  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0622  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.19 
 
 
603 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000352823  hitchhiker  0.00000108768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2231  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.62 
 
 
411 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000756298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1070  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.19 
 
 
603 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.229974  normal  0.255999 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0963  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.57 
 
 
460 aa  210  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.120749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>