More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B5597 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1762  group II intron-encoded protein LtrA  100 
 
 
604 aa  1250    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4556  group II intron-encoded protein LtrA  100 
 
 
604 aa  1250    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000506643  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5597  group II intron-encoded protein LtrA  100 
 
 
604 aa  1250    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.147853  hitchhiker  0.000000000602263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1533  RNA-directed DNA polymerase  49.43 
 
 
607 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0664  RNA-directed DNA polymerase  46.45 
 
 
605 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1685  retron-type reverse transcriptase  45.3 
 
 
599 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.950387  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C19  maturase MatR  44.98 
 
 
599 aa  491  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2196  RNA-directed DNA polymerase  41.43 
 
 
633 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.035125  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3928  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.43 
 
 
633 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3937  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.64 
 
 
613 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0690  RNA-directed DNA polymerase  41.68 
 
 
626 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0722  RNA-directed DNA polymerase  41.68 
 
 
626 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1921  RNA-directed DNA polymerase  38.45 
 
 
595 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4361  RNA-directed DNA polymerase  39.06 
 
 
593 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2960  RNA-directed DNA polymerase  39.06 
 
 
593 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4607  RNA-directed DNA polymerase  39.06 
 
 
593 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3169  RNA-directed DNA polymerase  45.24 
 
 
543 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4971  RNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 
572 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1532  RNA-directed DNA polymerase  51.24 
 
 
320 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0420  RNA-directed DNA polymerase  43.45 
 
 
351 aa  269  8.999999999999999e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  34.6 
 
 
503 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  36.2 
 
 
587 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0025  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  34.84 
 
 
507 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0016  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  34.84 
 
 
507 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.934591  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0017  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  34.84 
 
 
502 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485362  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0055  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  34.84 
 
 
502 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4858  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  34.84 
 
 
502 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4841  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  34.84 
 
 
502 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3327  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.04 
 
 
502 aa  210  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3347  RNA-directed DNA polymerase  34.47 
 
 
381 aa  207  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  35.05 
 
 
504 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0089  reverse transcriptase  34.15 
 
 
632 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0077  reverse transcriptase  34.15 
 
 
632 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0589009  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.69 
 
 
507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2082  RNA-directed DNA polymerase  32.47 
 
 
635 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0034  group II intron reverse transcriptase/maturase  34.16 
 
 
627 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0466  group II intron reverse transcriptase/maturase  34.97 
 
 
599 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  41.38 
 
 
439 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3857  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.69 
 
 
604 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  28.88 
 
 
483 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.88 
 
 
605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  33.15 
 
 
488 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18750  RNA-directed DNA polymerase  41.26 
 
 
455 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.844696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  44.39 
 
 
482 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  44.39 
 
 
482 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  44.39 
 
 
482 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.65 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1430  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.39 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1212  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.29 
 
 
455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.835307  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5394  RNA-directed DNA polymerase  36.8 
 
 
461 aa  164  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.172533  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01366  hypothetical maturase  36.53 
 
 
423 aa  163  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.702192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1589  RNA-directed DNA polymerase  40.78 
 
 
455 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0248  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.39 
 
 
460 aa  163  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0231  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.88 
 
 
460 aa  163  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1257  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.88 
 
 
460 aa  163  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1349  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.39 
 
 
457 aa  163  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000323944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1089  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.88 
 
 
460 aa  163  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000601644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0093  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.88 
 
 
460 aa  163  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.88 
 
 
460 aa  163  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0963  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.88 
 
 
460 aa  163  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.120749  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0939  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.88 
 
 
460 aa  163  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000533516  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0035  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.79 
 
 
643 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2231  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.09 
 
 
411 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000756298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3727  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.54 
 
 
465 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.17 
 
 
602 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00457  hypothetical maturase  36.24 
 
 
423 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  38.57 
 
 
454 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0688  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.88 
 
 
390 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000168901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1723  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.33 
 
 
420 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3877  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
455 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.340417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2818  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
455 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281251  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3099  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
455 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4399  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
455 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
455 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0412624  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5268  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
455 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136681  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0288  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
455 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2008  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
429 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3561  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
429 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1956  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.81 
 
 
429 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00339995  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2660  putative reverse transcriptase-maturase- endonucleas  39.32 
 
 
455 aa  160  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0955  group II intron, maturase  42.56 
 
 
434 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2471  group II intron, maturase  42.56 
 
 
434 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.546508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1245  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.45 
 
 
427 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2751  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.11 
 
 
618 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0791  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.32 
 
 
455 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589173  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0269  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.32 
 
 
429 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0904325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3200  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.83 
 
 
467 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24740  RNA-directed DNA polymerase  39.52 
 
 
591 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02784  hypothetical maturase  35.62 
 
 
423 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0013  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.15 
 
 
599 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.631939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3691  reverse transcriptase/endonuclease  30.18 
 
 
642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0120  reverse transcriptase  30.18 
 
 
642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0018  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.18 
 
 
642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3675  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.18 
 
 
642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0016  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.18 
 
 
642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3699  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.18 
 
 
642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.04 
 
 
422 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.04 
 
 
422 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.04 
 
 
422 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2214  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.9 
 
 
364 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>