More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4617 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  89.26 
 
 		 569 aa  1060    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  93.33 
 
 		 585 aa  1131    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 585 aa  1214    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  95.56 
 
 		 585 aa  1156    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  58.06 
 
 		 561 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  57.88 
 
 		 565 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  58.08 
 
 		 571 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  56.55 
 
 		 568 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  56.76 
 
 		 568 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  57.37 
 
 		 566 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 549 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  51.67 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  50.21 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  43.94 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  47.94 
 
 		 495 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  48.82 
 
 		 503 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  48.64 
 
 		 503 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  47.13 
 
 		 490 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  47.02 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  46.82 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  46.82 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  47.02 
 
 		 489 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  47.02 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  48.81 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  46.82 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  46.11 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  46.11 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  46.11 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  45.77 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  46.2 
 
 		 489 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  47.88 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  47.88 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  45.77 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  45.77 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  45.77 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  45.4 
 
 		 490 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  45.21 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  43.44 
 
 		 576 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  43.44 
 
 		 576 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  43.26 
 
 		 576 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  43.09 
 
 		 592 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  46.64 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  44.44 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  44.44 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  44.44 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  46.51 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  45.11 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  44.09 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  44.09 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  46.08 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  38.8 
 
 		 635 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  38.8 
 
 		 635 aa  354  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 		 634 aa  346  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.9 
 
 		 596 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.5 
 
 		 607 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.5 
 
 		 607 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.5 
 
 		 607 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.5 
 
 		 607 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  37.66 
 
 		 602 aa  339  7e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  36.76 
 
 		 553 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.24 
 
 		 648 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.24 
 
 		 648 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.16 
 
 		 661 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  37.41 
 
 		 554 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  37.74 
 
 		 627 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  37.74 
 
 		 627 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  37.62 
 
 		 548 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  37.62 
 
 		 548 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  37.62 
 
 		 548 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  37.62 
 
 		 548 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  37.62 
 
 		 548 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  37.62 
 
 		 548 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  34.4 
 
 		 589 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.36 
 
 		 437 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.05 
 
 		 502 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06460  RNA-directed DNA polymerase  43.04 
 
 		 311 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  36.79 
 
 		 587 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  30.94 
 
 		 666 aa  213  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  37.02 
 
 		 439 aa  210  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0846  retron-type reverse transcriptase-like protein  51.92 
 
 		 227 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 		 263 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 		 263 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  33.88 
 
 		 483 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.77 
 
 		 507 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  53.89 
 
 		 202 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 		 264 aa  185  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  32.54 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  34.74 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>