More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4498 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3327  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  65.94 
 
 
502 aa  688    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0025  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  66.14 
 
 
507 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4858  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  66.14 
 
 
502 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  94.64 
 
 
503 aa  990    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0055  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  66.14 
 
 
502 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4841  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  66.27 
 
 
502 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
504 aa  1041    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0017  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  66.14 
 
 
502 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485362  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0016  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  66.14 
 
 
507 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.934591  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8256  reverse transcriptase-like protein  93.88 
 
 
278 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00326311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3347  RNA-directed DNA polymerase  69.32 
 
 
381 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8264  18S rRNA intron 1 protein  85.66 
 
 
257 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0701764  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 
587 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.85 
 
 
507 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1762  group II intron-encoded protein LtrA  35.05 
 
 
604 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5597  group II intron-encoded protein LtrA  35.05 
 
 
604 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.147853  hitchhiker  0.000000000602263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4556  group II intron-encoded protein LtrA  35.05 
 
 
604 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000506643  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0664  RNA-directed DNA polymerase  26.14 
 
 
605 aa  219  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1533  RNA-directed DNA polymerase  31.2 
 
 
607 aa  216  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.33 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2196  RNA-directed DNA polymerase  29.12 
 
 
633 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.035125  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3928  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.12 
 
 
633 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  35.07 
 
 
483 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  35.5 
 
 
488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  31.84 
 
 
439 aa  213  7e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  34.69 
 
 
482 aa  209  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  34.69 
 
 
482 aa  209  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  34.69 
 
 
482 aa  209  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2085  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.06 
 
 
420 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1421  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.06 
 
 
420 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1201  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.06 
 
 
420 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1618  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000636906  hitchhiker  0.000000000000550097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2375  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0975  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.171918  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  34.63 
 
 
553 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.04 
 
 
422 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1685  retron-type reverse transcriptase  32.98 
 
 
599 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.950387  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C19  maturase MatR  32.71 
 
 
599 aa  207  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3937  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.88 
 
 
613 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.22 
 
 
548 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.22 
 
 
548 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.22 
 
 
548 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1269  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.73 
 
 
472 aa  206  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.418772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.22 
 
 
548 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.22 
 
 
548 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.22 
 
 
548 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0624  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1714  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.125991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3163  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.82 
 
 
420 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0976  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.307448  normal  0.190974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0584  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0142  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0812  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.158231  hitchhiker  0.0000219513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1387  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.017267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2185  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2652  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102915  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2067  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121404  normal  0.0104805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2778  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1923  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1901  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.73 
 
 
475 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0722  RNA-directed DNA polymerase  31.78 
 
 
626 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0690  RNA-directed DNA polymerase  31.78 
 
 
626 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.69 
 
 
472 aa  203  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0566133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  30.07 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1255  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.33 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2924  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.57 
 
 
434 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2051  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.57 
 
 
434 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3919  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.57 
 
 
434 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4151  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.57 
 
 
434 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.57 
 
 
434 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1471  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.57 
 
 
434 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000733074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.57 
 
 
434 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0955  group II intron, maturase  33.41 
 
 
434 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2471  group II intron, maturase  33.41 
 
 
434 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.546508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3727  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.09 
 
 
465 aa  199  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1292  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.57 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1508  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.34 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02784  hypothetical maturase  31.14 
 
 
423 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.18 
 
 
602 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01366  hypothetical maturase  31.63 
 
 
423 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.702192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2082  RNA-directed DNA polymerase  31.85 
 
 
635 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1921  RNA-directed DNA polymerase  31.07 
 
 
595 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  32.85 
 
 
490 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 
490 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 
490 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 
490 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1986  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.03 
 
 
433 aa  193  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.289767  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  30.4 
 
 
515 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 
490 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 
490 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 
490 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 
490 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>