More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02987 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  73.67 
 
 		 490 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  74.9 
 
 		 504 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  78.16 
 
 		 490 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  75.33 
 
 		 458 aa  730    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  76.94 
 
 		 490 aa  791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 490 aa  1015    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  73.67 
 
 		 490 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  74.54 
 
 		 489 aa  765    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  74.33 
 
 		 489 aa  763    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  74.69 
 
 		 504 aa  774    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 490 aa  1015    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  74.9 
 
 		 504 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 490 aa  1015    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  73.67 
 
 		 490 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 490 aa  1015    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  74.33 
 
 		 489 aa  763    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  72.45 
 
 		 490 aa  753    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  73.67 
 
 		 490 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  73.67 
 
 		 490 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  73.67 
 
 		 490 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  78.16 
 
 		 490 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  73.67 
 
 		 490 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  74.54 
 
 		 489 aa  765    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  78.16 
 
 		 490 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  52.61 
 
 		 495 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  52.61 
 
 		 495 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  52.55 
 
 		 495 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  51.26 
 
 		 490 aa  501  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 503 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  51.05 
 
 		 560 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  51.05 
 
 		 560 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  51.91 
 
 		 495 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  53.88 
 
 		 544 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  51.94 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  51.91 
 
 		 568 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  51.73 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  49.17 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  47.85 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  47.85 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  47.85 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  50.21 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  48.03 
 
 		 556 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  50.42 
 
 		 565 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  52.31 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  50.74 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06460  RNA-directed DNA polymerase  68.95 
 
 		 311 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  48.2 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  46.39 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  46.36 
 
 		 585 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  45.77 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 487 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  44.96 
 
 		 585 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  48.75 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  47.25 
 
 		 576 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  47.25 
 
 		 576 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  47.25 
 
 		 576 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  47.25 
 
 		 592 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.5 
 
 		 596 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  82.98 
 
 		 202 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  40.34 
 
 		 635 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  39.96 
 
 		 635 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.85 
 
 		 648 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.85 
 
 		 648 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 		 554 aa  303  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 553 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.41 
 
 		 661 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  39.09 
 
 		 634 aa  299  8e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.71 
 
 		 607 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.71 
 
 		 607 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.71 
 
 		 607 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.71 
 
 		 607 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.38 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.69 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.69 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.69 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.69 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.69 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.69 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3460  group II intron, maturase-specific domain-containing protein  67.68 
 
 		 202 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.3 
 
 		 437 aa  281  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  36.12 
 
 		 589 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  36.25 
 
 		 627 aa  256  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  36.25 
 
 		 627 aa  256  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.26 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  34.35 
 
 		 483 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0846  retron-type reverse transcriptase-like protein  54.81 
 
 		 227 aa  220  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  35.96 
 
 		 587 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  36.76 
 
 		 439 aa  196  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 503 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 263 aa  190  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 263 aa  190  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  33.63 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  33 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  45.67 
 
 		 264 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>