More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_pXO1_0011 on replicon NC_007322
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  100 
 
 
602 aa  1254    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  51.08 
 
 
553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  50.27 
 
 
548 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  50.27 
 
 
548 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  50.27 
 
 
548 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  50.27 
 
 
548 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  50.27 
 
 
548 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  50.09 
 
 
548 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  39.75 
 
 
635 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.15 
 
 
596 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  39.75 
 
 
635 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  38.45 
 
 
549 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  40.07 
 
 
634 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.37 
 
 
648 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.37 
 
 
648 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.51 
 
 
661 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  37.83 
 
 
568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  38.93 
 
 
561 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  37.19 
 
 
585 aa  350  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.63 
 
 
607 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.63 
 
 
607 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.63 
 
 
607 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.63 
 
 
607 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  41.21 
 
 
503 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 
566 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  36.75 
 
 
560 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  36.75 
 
 
560 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  40.44 
 
 
495 aa  343  5e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 
571 aa  343  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  38.15 
 
 
589 aa  343  7e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  37.21 
 
 
565 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 
515 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  36.59 
 
 
569 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  37.66 
 
 
585 aa  339  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  38.39 
 
 
554 aa  339  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  37.32 
 
 
568 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  36.19 
 
 
627 aa  336  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  36.19 
 
 
627 aa  336  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 
503 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  36.99 
 
 
585 aa  333  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  40.04 
 
 
495 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  38.78 
 
 
495 aa  326  6e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  38.78 
 
 
495 aa  326  6e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  39.52 
 
 
490 aa  326  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  40.28 
 
 
515 aa  325  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  40.28 
 
 
515 aa  325  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  40.28 
 
 
515 aa  325  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  36.28 
 
 
556 aa  323  8e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  40.32 
 
 
490 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  37.88 
 
 
504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  38.27 
 
 
504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  37.88 
 
 
504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  38.17 
 
 
490 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  38.17 
 
 
490 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  38.17 
 
 
490 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  38.17 
 
 
490 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  38.17 
 
 
490 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  38.17 
 
 
490 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  41.59 
 
 
490 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  41.59 
 
 
490 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  41.59 
 
 
490 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 
489 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  38.6 
 
 
489 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 
489 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 
489 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  41.59 
 
 
487 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  40.89 
 
 
490 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  41.36 
 
 
490 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  37.08 
 
 
544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  37.27 
 
 
490 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  39.39 
 
 
492 aa  300  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 
592 aa  298  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 
576 aa  296  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  36.94 
 
 
490 aa  296  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  38.02 
 
 
505 aa  296  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  36.94 
 
 
490 aa  296  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  36.94 
 
 
490 aa  296  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 
576 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 
490 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 
490 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 
490 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 
490 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 
576 aa  294  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.78 
 
 
437 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  37.45 
 
 
490 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  38.04 
 
 
458 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.8 
 
 
502 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  31.51 
 
 
666 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  35.52 
 
 
439 aa  230  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  46.64 
 
 
263 aa  217  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  46.64 
 
 
263 aa  217  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  46.94 
 
 
262 aa  216  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  45.2 
 
 
264 aa  214  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  33.09 
 
 
488 aa  209  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  33.98 
 
 
483 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  35.84 
 
 
587 aa  208  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.26 
 
 
507 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  30.17 
 
 
449 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
503 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  30.7 
 
 
504 aa  188  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>