More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2784 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  99.39 
 
 
490 aa  1014    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  78.16 
 
 
490 aa  833    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  99.39 
 
 
490 aa  1014    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  99.8 
 
 
490 aa  1019    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
490 aa  1021    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
487 aa  908    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  53.72 
 
 
492 aa  527  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 
576 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 
576 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 
576 aa  511  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  55 
 
 
592 aa  511  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  51.73 
 
 
495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  51.73 
 
 
495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  48.6 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  47.07 
 
 
556 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  49.68 
 
 
549 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  49.24 
 
 
495 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  48.46 
 
 
568 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  49.67 
 
 
490 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  48.45 
 
 
544 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  48.24 
 
 
561 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  47.49 
 
 
560 aa  428  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  47.8 
 
 
503 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  47.49 
 
 
560 aa  428  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  46.71 
 
 
568 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  46.75 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  48.83 
 
 
515 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  46.07 
 
 
490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  46.07 
 
 
490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  46.71 
 
 
565 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  46.07 
 
 
490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  46.07 
 
 
490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  46.07 
 
 
490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  46.07 
 
 
490 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  50.12 
 
 
505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  47.83 
 
 
490 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  44.77 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  47.58 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  44.65 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  49.03 
 
 
490 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  44.77 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  47.58 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  47.58 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  44.58 
 
 
489 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  44.58 
 
 
489 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  43.28 
 
 
566 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  44.58 
 
 
489 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  44.58 
 
 
489 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  47.1 
 
 
490 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  44.38 
 
 
571 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  43.55 
 
 
515 aa  385  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  43.55 
 
 
515 aa  385  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  43.55 
 
 
515 aa  385  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  45.98 
 
 
458 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 
569 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 
585 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  43.46 
 
 
585 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  44.49 
 
 
585 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  37.96 
 
 
635 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  41.59 
 
 
602 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  37.77 
 
 
635 aa  309  9e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.9 
 
 
596 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  38.91 
 
 
634 aa  294  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.88 
 
 
607 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.88 
 
 
607 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.88 
 
 
607 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.88 
 
 
607 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.11 
 
 
648 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.11 
 
 
648 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.5 
 
 
661 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  38.26 
 
 
554 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 
627 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 
627 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  35 
 
 
553 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.81 
 
 
548 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.86 
 
 
548 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.86 
 
 
548 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.86 
 
 
548 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.86 
 
 
548 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.86 
 
 
548 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  33.74 
 
 
589 aa  246  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.61 
 
 
502 aa  233  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.89 
 
 
437 aa  230  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06460  RNA-directed DNA polymerase  41.61 
 
 
311 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0846  retron-type reverse transcriptase-like protein  53.77 
 
 
227 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  33.95 
 
 
483 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  32.55 
 
 
439 aa  192  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  34.16 
 
 
587 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 
202 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.75 
 
 
507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  29.52 
 
 
449 aa  176  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  32.18 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  30.19 
 
 
666 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  33.26 
 
 
454 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 
263 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 
263 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>