More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2439 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  93.18 
 
 		 634 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  90.11 
 
 		 635 aa  484  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  89.73 
 
 		 635 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  89.35 
 
 		 262 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  86.64 
 
 		 554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  85.59 
 
 		 264 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  73.96 
 
 		 589 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  68.92 
 
 		 666 aa  327  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  65.09 
 
 		 648 aa  313  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  65.09 
 
 		 648 aa  313  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  65.67 
 
 		 607 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  65.67 
 
 		 607 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  65.67 
 
 		 607 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  65.67 
 
 		 607 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  64.22 
 
 		 661 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  58.82 
 
 		 627 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  58.82 
 
 		 627 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  66.81 
 
 		 596 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.83 
 
 		 502 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1513  hypothetical protein  93.5 
 
 		 164 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352722  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  46.64 
 
 		 602 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4733  hypothetical protein  85.6 
 
 		 125 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  46.09 
 
 		 553 aa  205  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  46.46 
 
 		 548 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  45.15 
 
 		 585 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  46.46 
 
 		 548 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  46.46 
 
 		 548 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  46.46 
 
 		 548 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  46.46 
 
 		 548 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  46.46 
 
 		 548 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  45.15 
 
 		 585 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  46.25 
 
 		 504 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 		 490 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 		 490 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 		 490 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 		 490 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 		 490 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 		 490 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  47.23 
 
 		 489 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  47.23 
 
 		 489 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  47.23 
 
 		 489 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  44.62 
 
 		 492 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 		 569 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  47.23 
 
 		 489 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  46.38 
 
 		 504 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  46.38 
 
 		 504 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  44.74 
 
 		 566 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 		 585 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 490 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 490 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 490 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 490 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  46.96 
 
 		 568 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  45.61 
 
 		 490 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  44.98 
 
 		 565 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  44.74 
 
 		 571 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  45.8 
 
 		 503 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 490 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 490 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 490 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  46.52 
 
 		 490 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  43.86 
 
 		 561 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  45.18 
 
 		 568 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  42.56 
 
 		 490 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 592 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  42.79 
 
 		 576 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  42.79 
 
 		 576 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  42.79 
 
 		 576 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  40.95 
 
 		 549 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  43.04 
 
 		 556 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  41.05 
 
 		 560 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  41.05 
 
 		 560 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  43.5 
 
 		 505 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.17 
 
 		 437 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  38.87 
 
 		 490 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 		 503 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 490 aa  169  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 490 aa  169  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 490 aa  169  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 490 aa  169  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  46.15 
 
 		 458 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 490 aa  169  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  39.91 
 
 		 515 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  39.91 
 
 		 515 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  39.91 
 
 		 515 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 487 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  41.56 
 
 		 495 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  41.56 
 
 		 495 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 495 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3635  hypothetical protein  77.57 
 
 		 115 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  41.85 
 
 		 495 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  42.29 
 
 		 449 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  42.48 
 
 		 544 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  41.84 
 
 		 515 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 202 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.75 
 
 		 507 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0846  retron-type reverse transcriptase-like protein  41.58 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2583  Group II intron maturase-specific domain protein  38.84 
 
 		 402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>