101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1513 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  333  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352722  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  94.21 
 
 		 262 aa  235  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  93.5 
 
 		 263 aa  234  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  93.5 
 
 		 263 aa  234  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  91.87 
 
 		 634 aa  231  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  89.26 
 
 		 554 aa  225  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  85.37 
 
 		 635 aa  213  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  85.37 
 
 		 635 aa  213  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4733  hypothetical protein  87.07 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  77.44 
 
 		 589 aa  204  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  71.54 
 
 		 666 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  82.11 
 
 		 264 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3635  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  58.43 
 
 		 648 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  58.43 
 
 		 648 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  60.67 
 
 		 661 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  63.1 
 
 		 596 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.61 
 
 		 607 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.61 
 
 		 607 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.61 
 
 		 607 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.61 
 
 		 607 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 627 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 627 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0430  hypothetical protein  71.64 
 
 		 71 aa  94.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.634781  normal  0.0284892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50 
 
 		 502 aa  90.5  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  52.38 
 
 		 449 aa  87.8  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  41.38 
 
 		 602 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  47.37 
 
 		 553 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  48.61 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  48.61 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  42.2 
 
 		 492 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  46.91 
 
 		 504 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  48.61 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  48.61 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  48.61 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  48.61 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  43.16 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  43 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  43 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  43 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  43 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  43 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  43 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  42 
 
 		 489 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  42 
 
 		 489 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  42 
 
 		 489 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  49.3 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  45.68 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  45.68 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  42 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4673  Group II intron maturase-specific domain protein  39.81 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.945234 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 		 490 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 490 aa  61.6  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 		 490 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 		 490 aa  61.6  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 		 490 aa  61.6  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 556 aa  61.6  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 		 487 aa  61.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  34.04 
 
 		 569 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  49.28 
 
 		 490 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  49.28 
 
 		 490 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  49.28 
 
 		 490 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  45.59 
 
 		 565 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1430  SwissProt accession number P19593-like protein  39.29 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  0.373599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  32.98 
 
 		 585 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  44.78 
 
 		 571 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  43.48 
 
 		 561 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  38.37 
 
 		 568 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  34.04 
 
 		 585 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  39 
 
 		 490 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 560 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 560 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  45.45 
 
 		 515 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  45.45 
 
 		 515 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  45.45 
 
 		 515 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  46.05 
 
 		 503 aa  57.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 568 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  36.11 
 
 		 490 aa  57.4  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  34.04 
 
 		 585 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1963  reverse transcriptase-like  66.67 
 
 		 49 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  40.96 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  37.66 
 
 		 495 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  37.66 
 
 		 495 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  40.7 
 
 		 592 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  43.28 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2583  Group II intron maturase-specific domain protein  38.82 
 
 		 402 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 549 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0846  retron-type reverse transcriptase-like protein  42.65 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  46.03 
 
 		 505 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  37.35 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  46.27 
 
 		 544 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 		 495 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>