103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4673 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4673  Group II intron maturase-specific domain protein  100 
 
 		 314 aa  630  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.945234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.09 
 
 		 648 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.09 
 
 		 648 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.18 
 
 		 661 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 		 627 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 		 627 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.89 
 
 		 502 aa  109  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.18 
 
 		 607 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.18 
 
 		 607 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.18 
 
 		 607 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.18 
 
 		 607 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.69 
 
 		 596 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  34.76 
 
 		 589 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  38.51 
 
 		 635 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  36.65 
 
 		 635 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 		 554 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  32.46 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  34.27 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 		 634 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  34.78 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2583  Group II intron maturase-specific domain protein  35.1 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.12 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4733  hypothetical protein  44.59 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  34.86 
 
 		 568 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  32.91 
 
 		 492 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  31.9 
 
 		 565 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  39.53 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  39.53 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  35.35 
 
 		 568 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0469  group II intron, maturase-specific  38.71 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1513  hypothetical protein  39.81 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352722  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  30.37 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  30.37 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  30.37 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  30.2 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  30.2 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  25.49 
 
 		 666 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 490 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  30.77 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  30.77 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  30.77 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0043  reverse transcriptase, interruption-C  30.32 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.58 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.58 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.58 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.58 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.58 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.58 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  30.17 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  30.87 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  30.87 
 
 		 592 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  30.52 
 
 		 553 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  35.23 
 
 		 576 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  27.52 
 
 		 566 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  28.19 
 
 		 495 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  35.23 
 
 		 576 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  30.28 
 
 		 561 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  28.86 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 490 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 490 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 490 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 490 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  29.66 
 
 		 503 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  30.28 
 
 		 560 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  30.28 
 
 		 560 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  26.83 
 
 		 490 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  30.63 
 
 		 515 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  31.13 
 
 		 569 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  30.17 
 
 		 585 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  29.31 
 
 		 585 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  34.07 
 
 		 556 aa  49.3  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  25.18 
 
 		 549 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  29.31 
 
 		 585 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3635  hypothetical protein  35.14 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.7 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  21.38 
 
 		 503 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1368  group II intron, maturase-specific domain-containing protein  32.53 
 
 		 145 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  24.2 
 
 		 490 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  26.95 
 
 		 490 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  44.59 
 
 		 504 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  44.59 
 
 		 504 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  44.59 
 
 		 504 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 		 489 aa  45.8  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  32.53 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  41.89 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  41.89 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  41.89 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  41.89 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  41.89 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  41.89 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  27.66 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  27.66 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>