More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2583 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2583  Group II intron maturase-specific domain protein  100 
 
 		 402 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.92 
 
 		 596 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  32.04 
 
 		 627 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  32.04 
 
 		 627 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  32 
 
 		 561 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  34.45 
 
 		 635 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  34.45 
 
 		 635 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  31.93 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  33.01 
 
 		 634 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.45 
 
 		 648 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.45 
 
 		 648 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  30.02 
 
 		 568 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 585 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 569 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 585 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.28 
 
 		 661 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  30.81 
 
 		 565 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  32.45 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 585 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.63 
 
 		 607 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.63 
 
 		 607 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.63 
 
 		 607 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.63 
 
 		 607 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  31.71 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  30.26 
 
 		 602 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.71 
 
 		 502 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  29.92 
 
 		 571 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  30.71 
 
 		 566 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  30.83 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  31.88 
 
 		 490 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  29.43 
 
 		 549 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  31.56 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  30.53 
 
 		 495 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  30.5 
 
 		 492 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  30.05 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  30.27 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  29.88 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  29.88 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  30.48 
 
 		 490 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  30.48 
 
 		 490 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  30.48 
 
 		 490 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  30.48 
 
 		 490 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  28.89 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  29.25 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  30.73 
 
 		 515 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  30.73 
 
 		 515 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  30.73 
 
 		 515 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  30.71 
 
 		 495 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  30.71 
 
 		 495 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  28.84 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  28.84 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  28.53 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  29.72 
 
 		 504 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  29.72 
 
 		 504 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  28.84 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  28.84 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  28.84 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  28.84 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  29.72 
 
 		 504 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 		 489 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  29.77 
 
 		 490 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  28.8 
 
 		 556 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  29.95 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 263 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 263 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  28.47 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  39.42 
 
 		 264 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  27.69 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  27.69 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  27.69 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  27.89 
 
 		 544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  27.91 
 
 		 490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  29.71 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 576 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 576 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 576 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 592 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.03 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  27.44 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  29.06 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3561  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.72 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3877  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.72 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2818  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.72 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281251  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3099  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.72 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4399  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.72 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.72 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0412624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5268  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.72 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>