104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0043 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0043  reverse transcriptase, interruption-C  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0181  HNH endonuclease family protein  91.37 
 
 
168 aa  268  7e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.65 
 
 
596 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  43.12 
 
 
338 aa  178  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  43.12 
 
 
338 aa  178  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  42.66 
 
 
635 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  41.47 
 
 
589 aa  167  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  42.2 
 
 
634 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.45 
 
 
607 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.45 
 
 
607 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.45 
 
 
607 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.45 
 
 
607 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  41.26 
 
 
627 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  41.26 
 
 
627 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  41.28 
 
 
635 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  39.36 
 
 
554 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.58 
 
 
648 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.58 
 
 
648 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.63 
 
 
661 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0469  group II intron, maturase-specific  39.36 
 
 
189 aa  136  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  35.32 
 
 
666 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  38.18 
 
 
503 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  34.08 
 
 
561 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  32.31 
 
 
515 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  40.13 
 
 
495 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  31.34 
 
 
568 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 
560 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 
560 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  34.5 
 
 
549 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  39.46 
 
 
495 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  31.94 
 
 
556 aa  102  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  30.94 
 
 
568 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 
503 aa  101  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  31.94 
 
 
565 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.31 
 
 
502 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 
585 aa  98.6  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  31.34 
 
 
571 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 
544 aa  97.8  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  46.28 
 
 
492 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 
585 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  34.38 
 
 
576 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  34.38 
 
 
576 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  30.88 
 
 
566 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 
576 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 
592 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
585 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  34.56 
 
 
495 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  34.56 
 
 
495 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  38.69 
 
 
449 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  35.21 
 
 
490 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  36 
 
 
515 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  36 
 
 
515 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  36 
 
 
515 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  29.46 
 
 
569 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1368  group II intron, maturase-specific domain-containing protein  40.38 
 
 
145 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  33.55 
 
 
490 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  33.55 
 
 
490 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  33.55 
 
 
490 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  32.43 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  32.43 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  32.43 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  32.43 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  32.43 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  32.43 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  31.98 
 
 
553 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  31 
 
 
602 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
490 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 
490 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 
490 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 
490 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 
490 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.77 
 
 
437 aa  82  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  31.9 
 
 
490 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 
490 aa  79  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  30.86 
 
 
505 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  30.14 
 
 
487 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06460  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
311 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
504 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
504 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
504 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  30.37 
 
 
490 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
458 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
489 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
489 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
489 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
489 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3460  group II intron, maturase-specific domain-containing protein  30.37 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  30.6 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  30.6 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  30.6 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  30.6 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  30.6 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  30.6 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  37.93 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  37.93 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  37.93 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  36.78 
 
 
490 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1671  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.58 
 
 
467 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1707  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.58 
 
 
467 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2349  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.58 
 
 
467 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>