More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4800 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  61.26 
 
 
635 aa  772    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  60.51 
 
 
634 aa  762    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  56.68 
 
 
589 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  61.56 
 
 
635 aa  782    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  60.52 
 
 
554 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  100 
 
 
666 aa  1374    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.22 
 
 
607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.22 
 
 
607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.22 
 
 
607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.22 
 
 
607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.51 
 
 
648 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.51 
 
 
648 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.79 
 
 
596 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  41.08 
 
 
627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  41.08 
 
 
627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  57.93 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  57.93 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.3 
 
 
661 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  68.92 
 
 
263 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  68.92 
 
 
263 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  66.93 
 
 
262 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.14 
 
 
502 aa  302  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  58.74 
 
 
264 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  34.85 
 
 
449 aa  253  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.51 
 
 
602 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  30.58 
 
 
568 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  31.49 
 
 
585 aa  220  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  29.26 
 
 
566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  31.32 
 
 
585 aa  217  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  32.39 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  29.32 
 
 
568 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  32.23 
 
 
503 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  30.94 
 
 
585 aa  213  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  30.83 
 
 
569 aa  211  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  29.57 
 
 
561 aa  210  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  29.79 
 
 
565 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0469  group II intron, maturase-specific  55.56 
 
 
189 aa  203  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  30.74 
 
 
553 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  32.53 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  27.63 
 
 
560 aa  197  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  27.63 
 
 
560 aa  197  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  33.55 
 
 
492 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  30.05 
 
 
576 aa  194  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  32.13 
 
 
495 aa  194  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 
576 aa  194  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  28.21 
 
 
571 aa  194  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.23 
 
 
548 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.23 
 
 
548 aa  193  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.23 
 
 
548 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  30.36 
 
 
576 aa  193  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  29.88 
 
 
592 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.23 
 
 
548 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  28.47 
 
 
549 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.23 
 
 
548 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.23 
 
 
548 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  29.9 
 
 
556 aa  189  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  31.08 
 
 
490 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  28.65 
 
 
515 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1513  hypothetical protein  71.54 
 
 
164 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352722  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  29.73 
 
 
504 aa  177  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  30.62 
 
 
490 aa  177  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  29.69 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  29.69 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  29.69 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  29.69 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 
504 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 
504 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 
489 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  28.93 
 
 
495 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  28.93 
 
 
495 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  29.28 
 
 
490 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  29.28 
 
 
490 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  30.19 
 
 
490 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  30.19 
 
 
487 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  29.98 
 
 
490 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  28.73 
 
 
544 aa  170  6e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 
490 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 
490 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 
490 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 
490 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 
490 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 
490 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4733  hypothetical protein  66.4 
 
 
125 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379468  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  29.25 
 
 
503 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  28.11 
 
 
490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  29.27 
 
 
505 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  29.64 
 
 
458 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  29.37 
 
 
515 aa  156  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  29.37 
 
 
515 aa  156  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  29.37 
 
 
515 aa  156  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.99 
 
 
437 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
490 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
490 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
490 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  29.91 
 
 
490 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3635  hypothetical protein  71.03 
 
 
115 aa  150  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_002978  WD0043  reverse transcriptase, interruption-C  35.32 
 
 
228 aa  129  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>