More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0846 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0846  retron-type reverse transcriptase-like protein  100 
 
 		 227 aa  460  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  60.8 
 
 		 549 aa  263  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  60.1 
 
 		 505 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  59.26 
 
 		 565 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  57.94 
 
 		 571 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  57.77 
 
 		 556 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  57.35 
 
 		 561 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  64.59 
 
 		 495 aa  250  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  64.59 
 
 		 495 aa  250  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  59.72 
 
 		 495 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  59.72 
 
 		 495 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  56.13 
 
 		 503 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  56.54 
 
 		 566 aa  247  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  60.68 
 
 		 490 aa  246  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  56.02 
 
 		 560 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  56.02 
 
 		 560 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  57.48 
 
 		 568 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  53.55 
 
 		 515 aa  235  4e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  53.55 
 
 		 515 aa  235  4e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  53.55 
 
 		 515 aa  235  4e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  57.79 
 
 		 503 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  57.95 
 
 		 544 aa  231  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  54.81 
 
 		 490 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  54.81 
 
 		 490 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  54.81 
 
 		 490 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  54.81 
 
 		 490 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  53.99 
 
 		 568 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 504 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 504 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 504 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 490 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 490 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 490 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 490 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 490 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  55.22 
 
 		 490 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  54.73 
 
 		 490 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  54.23 
 
 		 489 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  54.23 
 
 		 489 aa  222  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  54.23 
 
 		 489 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  54.23 
 
 		 489 aa  222  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  60.48 
 
 		 515 aa  221  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  52.97 
 
 		 490 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  51.18 
 
 		 490 aa  221  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  53.47 
 
 		 490 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  53.47 
 
 		 490 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  53.47 
 
 		 490 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  53.77 
 
 		 490 aa  218  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  53.77 
 
 		 490 aa  218  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  53.77 
 
 		 490 aa  218  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  53.77 
 
 		 490 aa  218  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  54.27 
 
 		 490 aa  218  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  53.77 
 
 		 487 aa  217  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  52.43 
 
 		 585 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  51.76 
 
 		 492 aa  214  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  51.94 
 
 		 569 aa  214  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  51.26 
 
 		 592 aa  214  9e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  51 
 
 		 576 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  51.26 
 
 		 576 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  51 
 
 		 576 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  51.46 
 
 		 585 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  51.92 
 
 		 585 aa  210  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  57.46 
 
 		 458 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  55.75 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.81 
 
 		 596 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.08 
 
 		 607 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.08 
 
 		 607 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.08 
 
 		 607 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.08 
 
 		 607 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.29 
 
 		 661 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  41.58 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  41.58 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  41.87 
 
 		 635 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.33 
 
 		 648 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.33 
 
 		 648 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 553 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  41.87 
 
 		 635 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  41.36 
 
 		 602 aa  138  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  40.89 
 
 		 554 aa  138  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  41.87 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  42.16 
 
 		 264 aa  134  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.73 
 
 		 548 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.73 
 
 		 548 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.73 
 
 		 548 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.73 
 
 		 548 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.73 
 
 		 548 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  38.73 
 
 		 548 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  41.38 
 
 		 627 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  41.38 
 
 		 627 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  40.98 
 
 		 634 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.71 
 
 		 502 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1430  SwissProt accession number P19593-like protein  54.72 
 
 		 129 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  0.373599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  35.15 
 
 		 589 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1245  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.15 
 
 		 427 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.25 
 
 		 507 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.54 
 
 		 437 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1762  group II intron-encoded protein LtrA  36.36 
 
 		 604 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3857  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.88 
 
 		 604 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4556  group II intron-encoded protein LtrA  36.36 
 
 		 604 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000506643  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0086  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.47 
 
 		 493 aa  96.7  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>