25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1963 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1963  reverse transcriptase-like  100 
 
 		 49 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  69.23 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1513  hypothetical protein  66.67 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352722  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  66.67 
 
 		 635 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  66.67 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4733  hypothetical protein  66.67 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  66.67 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  66.67 
 
 		 635 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  66.67 
 
 		 634 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  68.57 
 
 		 554 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  65.71 
 
 		 661 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  62.86 
 
 		 648 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  62.86 
 
 		 648 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  58.97 
 
 		 596 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  64.86 
 
 		 607 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  64.86 
 
 		 607 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  64.86 
 
 		 607 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  64.86 
 
 		 607 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  58.97 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  61.54 
 
 		 589 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  56.1 
 
 		 627 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  56.1 
 
 		 627 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3635  hypothetical protein  64.71 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  56.41 
 
 		 666 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  50 
 
 		 602 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>