36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0212 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  61.76 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  47.89 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  27.17 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  28.05 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  29.21 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  29.21 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  29.27 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  29.27 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  33.73 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  32.47 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  35.96 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  33.75 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  43.28 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  33.75 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5070  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 324 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  36.36 
 
 		 299 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 299 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  29.76 
 
 		 105 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 276 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  30.67 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4083  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>