20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8187 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  100 
 
 		 276 aa  554  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4083  HNH endonuclease  91.18 
 
 		 116 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5070  HNH endonuclease  93.14 
 
 		 116 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  43.1 
 
 		 388 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 388 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1606  HNH endonuclease  61.96 
 
 		 108 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.982514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0765  HNH endonuclease  55.79 
 
 		 111 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  38.27 
 
 		 370 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  25.28 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3540  HNH endonuclease  43 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0644  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 102 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0288065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  41.25 
 
 		 110 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  29.45 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  26.9 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1896  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>