12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5070 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5070  HNH endonuclease  100 
 
 		 116 aa  233  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4083  HNH endonuclease  92.24 
 
 		 116 aa  214  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  93.14 
 
 		 276 aa  197  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1606  HNH endonuclease  62.96 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.982514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0765  HNH endonuclease  55.86 
 
 		 111 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3540  HNH endonuclease  48.25 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0644  HNH endonuclease  35.51 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0288065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  43.66 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1896  hypothetical protein  43.14 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  38.03 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  39.29 
 
 		 299 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1305  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.500836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>