38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1121 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  100 
 
 		 178 aa  377  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  36.75 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  35.04 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  30 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  41.46 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  41.46 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  34.91 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  35.79 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  42.5 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  30.99 
 
 		 116 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 116 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 116 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  31.63 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  31.63 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 131 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  32.5 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  30.85 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  34.02 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 105 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 112 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 89 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 89 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  32.58 
 
 		 89 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  23.33 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  26.17 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  27.38 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  30.69 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  37.14 
 
 		 118 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1857  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  32.91 
 
 		 119 aa  42  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1122  HNH endonuclease  22.08 
 
 		 228 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  27.69 
 
 		 119 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  27.38 
 
 		 112 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  27.66 
 
 		 100 aa  41.6  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  29.21 
 
 		 119 aa  41.2  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 81 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  27.38 
 
 		 111 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  30.67 
 
 		 113 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>