54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0668 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  44.16 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  30 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  40.4 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  46.05 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  40.78 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  45.45 
 
 		 99 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  31.33 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  45.31 
 
 		 105 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  40.54 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  36.63 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  39.47 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  43.55 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  44.26 
 
 		 253 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  27.97 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  41.89 
 
 		 116 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  28.06 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  38.81 
 
 		 116 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  37.29 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  39.71 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  26.67 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 112 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0017  HNH endonuclease domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  36.59 
 
 		 120 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  31.76 
 
 		 113 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 101 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  44.83 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  25.34 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  35.21 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1453  hypothetical protein  26.9 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  30.49 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  30.49 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  25.41 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  31.34 
 
 		 119 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  25.77 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  36 
 
 		 129 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  35.8 
 
 		 118 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  29.58 
 
 		 115 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 89 aa  41.2  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 89 aa  41.2  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 111 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 89 aa  40.8  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>